图-134的缺点也相当突出，虽然它的发动机放置在尾部，但依然被认为是最嘈杂的客机。2002年国际民航组织（ICAO）附录16第3章生效后，图-134受噪音限制，被禁止飞往西欧国家领空。

2007年3月17日，俄罗斯联合航空471号航班（UT471）执飞从苏尔古特机场飞往别尔哥罗德国际机场的航班，中间经停萨马拉库鲁莫奇机场时，一架注册号RA-65021的图-134A-3客机发生硬着陆，导致飞机结构失效解体，机上57人中，导致6人死亡，20人受伤。事故调查显示，UT471号航班事故最大的可能原因是恶劣的天气和飞行员操作事故。

2008年1月1日，图-134最大的运营商俄罗斯航空公司退役了旗下所有该型客机。俄罗斯国内大部分图-134仅用作商务包机。

2011年6月，时任俄罗斯总统德米特里·梅德韦杰夫指示俄罗斯交通部，从2012年起在商业航班上退出图-134。2019年5月20日，Alrosa 航空公司执飞了俄罗斯境内图-134客机最后一次客运飞行。现在苏霍伊超级喷气机100（SSJ100）在俄罗斯民航中代替了图-134的位置。

飞行安全数据显示，在1966年至2011年间，一共有76架图-134发生机身损毁事件，图-134的机身损毁率为8.89%。一共导致1387人遇难。

其中涉及图-134最严重的一起事故是1979年8月11日，因空中交通管制错误，导致两架图-134客机在乌克兰第聂伯罗策任斯克附近相撞，事故导致两架客机上178人全部遇难。

图、1979年8月11日，苏联民航7658号航班（图-134A/CCCP-65816）撞上了苏联民航7889号航班（图-134AK/CCCP-65735）

1970~1980年：图-134A

1970年，图波列夫设计局推出了图-134A。机身加长了2.1米，座位数在76~84个。搭载了更先进的D-30III或D-32发动机，减少了燃油消耗，增加了反推器，取消了降落伞，机身尾部还安装了辅助动力装置（APU）。重新设计了玻璃机鼻，新型雷达的应用将导航员的位置转移到驾驶舱。

1980~1984年：图-134B

图-134B是图-134系列的现代化机型，增加了大型后部紧急出口，机组成员减少到3人，重新设计的客舱、货舱布局，乘客座位增加至80个。新增了Groza-134 雷达系统，彻底取消了玻璃机鼻。

在1966年至1989年间，哈尔科夫航空厂一共生产854架图-134飞机，它也成为产量仅次于图-154（1026架）和雅克-40（1012架）的苏制客机。