部分单位为了降低社保成本，会给农籍职工缴纳“三险”，虽然“三险”也是国家规定的社会保险，但是待遇与“五险”还是有区别的。
“五险”包括：养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险。
“三险”包括：养老保险、医疗保险、工伤保险。
“三险”缴费基数一般都低于“五险”缴费基数，各地对“三险”、“五险”的缴费基数都是有区别对待的，这个直接影响员工的退休养老保险待遇。但天津在2018年将两项保险的缴费基数进行了统一，统一为3364元，部分地区目前仍没有统一的。
二、医疗保险待遇不同两个险种的共同缴费项目：养老和医疗与个人有关，工伤缴费比例是根据单位性质确定的，与个人无关。
无论是“五险”还是“三险”，养老保险缴纳比例均为：单位19%，个人8%。
“五险”的医疗保险缴纳比例为：单位10%，个人2%。
“三险”的医疗保险只有单位缴纳，个人不缴纳，比例为8%。
如果单位给员工缴纳的是“三险”，那么个人在看病就医时不能联网结算，也没有个人医保账户。
“三险”应该说是专门为农籍人员缴纳的，既然是农业户口，就不存在失业的说法，所以国家规定“三险”不必缴纳失业保险，员工失业当然也无法享受失业金。
可目前的问题是，好多农籍人员在长年城镇工作的，老家早就没有耕地了，因各地落户政策不同，又没有办法在工作所在地落户的，如果失业了，因为缴纳的是“三险”，而不能正常领取失业金。
四、生育待遇不同因为“三险”是不缴纳生育保险的，如果女员工在孕期缴纳的是“三险”，那么一系列生育待遇都无法享受，如生育津贴，孕检，生产等费用。
“三险”制度正在逐渐取消目前国家正在逐步取消户籍限制，各地的“三险”政策也都是有时限的，随着户籍制度的统一，“三险”制度也在逐渐消失。
天津在今年7月就对之前“三险”政策进行了调整，在未经员工同意的情况下，统一改为缴纳“五险”，如果员工同意，可以按照“三险”中的医疗保险进行缴纳医疗费用，但其他费用还是需要按照“五险”交的。可好多单位不会跟员工协商，还是按照之前的三险待遇缴纳医疗保险，个人不使用医保卡的话也不会知道，知道了也较难维权。
市人力社保局市财政局关于农籍职工参加社会保险有关问题的通知
各区人力资源和社会保障局、财政局，各委办局（集团公司）人力资源部门，有关单位：
为深入贯彻以人民为中心的发展思想，切实维护农籍职工社会保险权益，降低企业劳动用工成本，按照《社会保险法》等有关规定，现就继续促进农籍职工参加社会保险有关问题通知如下：
自2018年7月1日起，原按照《市人力社保局市财政局关于印发促进农籍职工参加社会保险若干规定的通知》（津人社局发〔2013〕40号）先行参加养老、医疗和工伤保险的企业及其农籍职工，恢复参加养老、医疗、工伤、生育和失业保险。单位和个人经协商一致，企业可继续按农籍职工个人缴费基数之和的8%缴纳基本医疗保险费，农籍职工本人不缴费，只享受基本医疗保险待遇，不建立医疗保险个人账户。
本通知自2018年7月1日起施行，至2019年12月31日废止。
