地铁3号线途经浦口区、鼓楼区、玄武区、秦淮区、雨花台区和江宁区，共设置29座车站，分别是林场站、星火路站、东大成贤学院站、泰冯路站、天润城站、柳洲东路站、上元门站、五塘广场站、小市站、南京站、南京林业大学·新庄站、鸡鸣寺站、浮桥站、大行宫站、常府街站、夫子庙站、武定门站、雨花门站、卡子门站、大明路站、明发广场站、南京南站、宏运大道站、胜太西路站、天元西路站、九龙湖站、诚信大道站、东大九龙湖校区站、秣周东路站。

地铁4号线一期工程途经鼓楼区、玄武区、栖霞区和江宁区，共设置18座车站，分别是龙江站、草场门站、云南路站、鼓楼站、鸡鸣寺站、九华山站、岗子村站、蒋王庙站、王家湾站、聚宝山站、徐庄站、金马路站、汇通路站、灵山站、东流站、孟北站、西岗桦墅站、仙林湖站。

地铁10号线途径浦口区、建邺区和雨花台区，线路西起雨山路站，跨越长江进入河西新城，东至安德门站，线路总长21.6千米；共设置14座车站，其中地下站13座，高架站1座。车站由西至东分别为雨山路站、文德路站、龙华路站、南京工业大学站、浦口万汇城站、临江.青奥体育公园站、江心洲站、绿博园站、梦都大街站、奥体中心站、元通站、中胜站、小行站、安德门站。

　　地铁S1号线途经雨花台区和江宁区，共设置9座车站，分别是南京南站、翠屏山站、河海大学·佛城西路站、吉印大道站、正方中路站、翔宇路北站、翔宇路南站、禄口机场站、空港新城江宁站。