但6D2的拨轮采用了更为密集的菱形浮雕纹路，手感会更好一些，方向按键相比6D的略小一些。另外Lock锁也是用了与6D不一样的拨杆设计。

6D2终于加上了翻转屏，可以多角度旋转，而且还有触摸功能，使用起来更加方便，对于某些特殊角度的拍摄来说，翻转屏的作用非常的大。

6D2在快门和拨轮之间加入了一个自动对焦区域选择模式切换按钮，这个按钮在80D上出现过，配合对焦点选择键可以把对焦操作得更加迅速。

6D2的左侧接口与6D有些不同，快门线接口设计在了正面，原来快门线的位置现在是NFC无线传输发射器。不过说真的6D2依然没有耳机监听接口的确有些奇怪，虽然对于比较专业的团队/个人都是用录音笔 麦克风来收音的，但更多的普通玩家并不会配备这么多的外设装备。