乳酸菌
第一名：乳酸粪肠球菌、屎肠球菌，乳酸片球菌
它们的作用有如下几个：
① 抑制弧菌，在养殖水体中达到1.2万个/毫升的乳酸菌含量时（只有强微可以廉价做到这点），水体中几乎检测不到弧菌，绿弧菌一个也没有，并可维持20天以上，这是一般消毒剂所达不到的；
② 维持稳定的PH值，现代水产往往PH比较高，坚持使用乳酸菌可以降低PH，但也不会无限降低，后期投料量大时，土塘的PH可低到7.0，但可以通过其他手段加以调节，高位池的PH则没有问题；稳定PH的同时，也控制了蓝藻的爆发；
③ 坚持使用乳酸菌，往往可以容易获得非常优质的硅藻相，这一点暂时无法用理论解释，实践表现如此，且非常稳定，而通常我们认为硅藻水是不稳定的；
④ 分解有机碎屑，分解死藻颗粒，吸收氨氮：在这方面，粪肠球菌和屎肠球菌是乳酸菌中分解力最强的，且它们本身就是从粪便中分离出来的菌种，在粪肠后肠中进化而来，能适应高有机质环境，能适应高氨氮环境，并吸收利用它们；分解吸收的结果是菌相的完善和巩固，一部分变成二氧化碳，一部分变为菌体本身，一部分作为代谢产物如乳酸和特殊维生素而释放于水体中。
反硝化细菌
第二名：反硝化细菌
反硝化细菌的作用：
①用于降低亚硝酸盐，能转化亚硝酸盐成为氮气，挥发到空气中去，彻底脱离水体这个环境，在物质循环的基础上解除水体中总氮过多的危害。所以，它是一种瘦水的过程，同时因为减少了总氮，所以坚持用反硝化细菌后藻类也不至于过浓，而现代水产养殖往往藻相过浓，所以，反硝化细菌也往往用于蓝藻处理当中；
②在对虾土塘养殖中，反硝化作用的结果，总体是升PH的，尤其是土塘表现明显，这是基于土塘底泥有机质丰富的特点，且大多底泥有机质是短链脂肪酸，反硝化细菌需要一些底泥有机质作为电子供体，这消耗了底泥中的有机酸性物质，降低了底泥生物耗氧量。
注意事项：
如果之前从未用过反硝化细菌的，则在底泥中蓄积了很多的有机质，和硝化反应积累的硝酸盐，它们在反硝化过程中，先会变成亚硝酸盐，然后再通过两步反应变成氮气。如果底泥太厚（硝酸盐之前积累太多），会造成亚硝酸盐这个中间产物短时间（一般是3～7天）不降反升，即在底泥厚的土塘中，反硝化过程，往往是亚硝酸盐先升后降的，但一旦底泥中的硝酸盐消耗得差不多了，最终亚硝酸盐会一直稳步下降，并下降到非常低的水平或检测不到的水平。建议使用反硝化细菌的时候采用少量多次的原则，以免亚硝酸盐突然增高太快。
硫化氢氧化细菌
第三名：硫化氢氧化细菌
主要作用是分解淤泥和水体中的硫化氢。泥低或者水体发臭，实际上就是淤泥和水体中的有机残骸被腐化细菌分解后释放硫化氢导致的。硫化氢会导致鱼虾慢料，很多养殖户在养殖时并不会检测水体中硫化氢的含量，导致不明原因慢料，常常是因为水体中的硫化氢含量升高引起的，而硫化氢氧化细菌则专门用于把硫化氢分解成无害的硫酸盐。
芽孢杆菌
第四名：芽孢杆菌和酵母菌
作用：枯草芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌都是分解力极强的菌株，它们主要着力于分解大分子有机碎屑，分解大分子有机物（通常用来处理倒藻或者水中大泡泡太多等情况）。特点是耗氧量较大，需要配合增氧设备。缺点是虽然分解力强，但是持续时间比较短。
光合细菌
第五名：光合细菌
光合细菌是水塘的土著菌种之一，它们不需要你额外的提供有机营养物质（如葡萄糖、蛋白质、维生素之类），它们就能自己生长繁殖下去的。光合细菌的优点很多，可以迅速分解有机质和降氨氮和改善水质，优化藻相，并提高水体自我净化能力。但光合细菌的缺点也同样明显：它对水体净化的速度太慢了，跟不上现代高密度养殖的需求，用量从原来的1公斤/亩，增加到3公斤/亩，再增加到5公斤/亩，到现在已有用到了10公斤/亩的。
解钾菌
第六名：解磷、解钾菌
解磷、解钾菌可以将难溶或难以利用的有机磷（钾）和无机磷（钾），转化成植物或藻类可以吸收利用的溶解磷（钾），有利于优质藻相的形成。
