1996年3月22日，这是游戏史上值得纪念的一天，当所有人的注意力都聚焦在史克威尔发布PS版《最终幻想7》的震撼新闻之时，《生化危机》初代无声无息的悄然问世了。发售的前三周，这款游戏毫无大卖的势头，然而游戏的高品质在玩家之间口耳相传，在长达一年的时间里游戏长卖不断，到1996年末《生化危机》在日本本土出货量一举突破百万大关，成为PS主机平台上首个破百万销量的原创游戏，至此《生化危机》系列的恐怖传奇正式拉开了帷幕。

2002年发售于任天堂的NGC平台（原计划在N64平台发售，但由于主机性能不足和开发进度拖延改为NGC），是《生化危机1》的前传，取名为0的含义则是“原始，开头”之意。本作在画面和游戏性都有所进步，因更换平台的重新制作反在NGC上达到一流素质。但由于NGC主机当时不景气，从而游戏销售不佳，国内的知名度也相对较低。却仍然是生化危机系列不可或缺的一环。后在2008年移植到Wii平台。

生化危机0

【游戏故事】1998年7月，在浣熊市周边地区，有关离奇的谋*事件的传闻不断，据说死者尸首被撕咬得残缺不全。城市精锐特种部队，S.T.A.R.S.（特殊战术及救援部队），派出bravo小队前往事发地点。可是，由于发动机不明故障，bravo小队的直升机在森林里紧急着陆。他们偶然发现一辆严重损毁的监狱护送车以及被残忍肢解的海军看守的尸体。恩里克·马里尼（Enrico Marini），bravo小队的队长，命令进行搜寻比利·柯恩（Billy Coen），一个逃离护送的前海军少尉。bravo小队的新成员，瑞贝卡·查姆柏斯（Rebecca Chambers），发现了一辆停在森林里的火车并进去调查……

恐怖传奇的开端，系列第一作。1996年发售于PS，成为PS平台上首个销量破百万的游戏。由三上真司担任监督。在那个3D技术还不成熟的时代，游戏巧妙的将2D背景和3D人物结合，避免了技术原因带来的画面粗糙，同时还让游戏拥有了近似于纯3D游戏的操作感，使玩家眼前一亮。CAPCOM也因此再次扬名于业界。之后的2002年，在任天堂的NGC和Wii平台上发售了《生化危机1重制版》。

生化危机1

【游戏故事】位于浣熊市（Raccoon City）的郊区森林地方发生了离奇的*人事件，而受害者的身体上有曾经被生物咀嚼过的伤痕而且大部份还支离破碎。浣熊市的人员派出S.T.A.R.S.特种部队的Bravo队调查但却不久音频全无。S.T.A.R.S.紧接着再派出Alpha队调查在郊区的森林处竟然遇上不明生物袭击，一位队员被*，生还的队员则逃进郊区的一所别墅（普遍称为“洋馆”）中，在洋馆中众人遇上一群被T病毒感染的丧尸。这些丧尸以活人为食物并袭击Alpha队员吉尔·瓦伦蒂安（Jill Valentine）及克里斯·雷德菲尔德（Chris Redfield），在一边逃生一边找寻对外联络的方法时，他们发现到一切都是由大型跨国制药企业安布雷拉公司（Umbrella）泄漏的T病毒所引起的……

继生化危机初代大受欢迎之后，1998年CAPCOM继续在PS平台上发售了《生化危机2》，之后在N64、DC，PC等多平台都有移植。其实早在《生化危机1》发售之后，制作人三上真司就立即开始着手《生化危机2》的开发，并且定于1997年3月发售，但在游戏初版完成至80%时，三上真司对此版本却极度不满，于是最终决定将已有部分推翻重新制作，这个被否决的初版往后被玩家戏称为《生化危机1.5》。也正是因为这次推翻重制，使得三上真司对作品追求极致完美，和一丝不苟的性格被玩家们所称道。《生化危机2》发售后，以其一流的游戏素质取得了空前的成功，成为不少玩家心中不变的经典。

生化危机2

【游戏故事】浣熊镇郊外的洋馆别墅的爆炸，T病毒被消灭，但是一切真的就结束了吗？答案是没有。安布雷拉公司高级研究员威廉·博肯（William Birkin）在研究G病毒成功之际，公司高层妄想抢夺其研究成果，并派出U.S.S.特种部队Alpha小组前往抢夺。G病毒被抢走，威廉身中数枪，为了报复，威廉将G病毒注入自己体内，变成被感染的怪物并成功的消灭了Alpha小组，同时T病毒也被老鼠散播到整个浣熊市，使市民几乎都被感染。 这时，新人警官里昂·斯科特·肯尼迪（Leon Scott Kennedy）来到浣熊市警察局上任，遇到了S.T.A.R.S.队员克里斯的妹妹克莱尔·雷德菲尔德（Claire Redfield），为了寻找失去音讯的哥哥也来到了浣熊市，两人一同遭遇了丧尸……

系列第三部本篇续作，1999年《生化危机3》率先在PS平台上发售，之后又陆续移植到了PC，世嘉DC和任天堂的NGC平台，本作的故事被好莱坞电影《生化危机：启示录》作为故事蓝本。在这部作品中，三上真司力求给玩家一种“无法逃脱的恐惧感”，塑造了“追踪者(Nemesis)”这又一经典怪物。在PS主机末期游戏仍然受到一致好评。