对于两宫听政时期二人之间的关系，《清宫遗文》中有如下记叙：“当时的天下人都说东宫太后以德服人，遇到生*予夺以及赏罚均由其做主。而西宫天后则能力出众，批阅奏折以及权衡利弊全都由慈禧负责。每逢朝见，东宫太后见群臣一言不发，所以，经常叫西宫太后站出来评讲奏折。”由此可见，慈安其实对权力毫无兴趣，平时的大小事务均交给慈禧打理。
古人最讲究名分，宫廷更是如此，慈安是正宫太后，所以，即便是比她大两岁的慈禧在平时也要叫她一声“姐姐”。虽说，慈禧要负责大小事务，但是，凡事慈禧都会先向慈安请示后再做处理，丝毫不敢僭越，哪怕慈安每次都不会产生异议。
因此，两人共同秉政长达二十年，双方的关系始终处于相对和谐稳定中，二人之间从未有过大的争端和分歧，这是古往今来后宫嫔妃中前所未有的。
但二人虽和谐，却也有些小摩擦产生。
例如：慈安曾下令除掉慈禧的贴身太监安德海，这件事就曾让慈禧太后耿耿于怀。安德海小人得志，深得慈禧宠爱。因为，安德海曾帮助慈禧摆平不少政敌，逐渐成了慈禧的贴身心腹，在朝中暗自发展势力，日渐做大，不将慈安和皇帝放在眼中。
同治八年，安德海借着同治大婚需采办龙袍为由，在慈禧的授意下出宫南下。按照清宫祖制，太监禁止踏出紫禁城一步，安德海不但违背祖制，还一路招摇过市，收受贿赂，所过之处地方官均不敢吭声。
在经过山东时，安德海被耿直的山东巡抚抓了起来，以其违反祖制为由请求朝廷发落。慈安早就听说安德海内宫的所作所为，此时正赶上慈禧生病无法下床，慈安便召集文武大臣商量这件事，群臣对安德海颇有微辞，一致认为要将其*之后快。
就这样，慈安同意山东巡抚将安德海定罪问斩。
但是，这件事就是慈禧要谋害慈安的原因吗？其实不然，此事过后，慈禧虽痛失心腹，却并未为难山东巡抚，反而嘉奖了这位清正廉洁的好官。在国家大局面前，慈禧尚且能做嘉奖巡抚到让群臣信服，又怎会谋害慈安落人话柄呢？
其实，后世学者依据慈安这一病情的进展记录，咨询资深中医专家，最终得出，慈安死因多半为脑血管疾病急性发作所导致。
其根据是：首先、病情特点：起病急骤，进展迅速。按照现代医学判断，如此快速的病情进展多见于心脑血管疾病。其次、临床表现：“神识不清”应为有意识障碍；“牙紧”、“有遗尿情形”应为现代中医所称的牙关紧闭和尿失禁。
最终辨证分析得出：依据以上症状，这一病症按照中医学辨证为脑中风病。而在《翁同龢日记》中，翁同龢记载的御医脉案为“类风痫甚重”，实际就应归属于当今中医学疾病中的中风范畴。由此，可以初步判断，慈安所患之病应为脑中风，也就是现代医学中的脑血管疾病。
参考资料：
【《翁同龢日记》、《清稗类钞》、《述庵秘录》】
