3.0升V6引擎

还推出了一系列新的发动机，1.8升发动机被抛弃，取而代之的是131马力的2.0升动力装置。1.9升涡轮增压直接喷射（TDI）引擎经过调整，最大输出功率为131马力，扭矩为310牛米，并与六速手动变速箱匹配。2.4升V6引擎被命名为30 valves，并获得了额外的5马力和更好的平衡性，2.8升V6发动机被220马力的3.0升发动机取代。对2.7升涡轮增压发动机进行了改进，其功率为250马力和330牛米。V6柴油机也进行了轻微修改，可产生了163马力和350牛米的扭矩。还推出了功率更大的新型V6柴油机，功率为179马力和370牛米的扭矩。2001年上市的4.2升V8发动机性能保持不变。

奥迪allroad quattro车型

此外，大多数前轮驱动车型都配备了多电子无级变速器。除2.0升汽油机和1.9升TDI引擎外，所有车型均配备奥迪标志性的四轮驱动系统。四轮驱动版本的旅行车，具有提高的离地间隙和略微改变的造型，作为奥迪的第一款跨界SUV奥迪allroad quattro销售。

第二代A6入选《汽车与驾驶员》杂志2000年和2001年的十大最佳车型名单。中期改款后的2005年A6还获得了2005年世界年度汽车奖。此外，经过翻新的第三代A6 3.0T车型赢得了两项“轿车和驾驶员”大奖，与宝马5系、梅赛德斯-奔驰E级、捷豹XF和英菲尼迪M等其他轿车竞争。

第三代C6 (Typ4F, 2004–2011)

中期改款前奥迪A6前视图

中期改款前奥迪A6后视图

Typ 4F A6于2004年发布。2001年由和田聪设计，这款车型在视觉上是C5的进化，但车身加长至4927毫米，并配备了全新的奥迪“单框架格栅”。与其他当代奥迪车型一样，A6有一条“龙卷风线”，从前车灯一直延伸到车身肩部下方的尾灯。