马来西亚位于赤道附近，属于热带雨林气候和热带季风气候，终年高温多雨，无明显的四季之分。一年之中的温差变化极小，白天平均气温在31-33℃之间，夜间平均气温在23-28℃之间，高原地区的夜间气温可低至16-18℃。全年雨量充沛，年均降雨量为2000-2500毫米。每年10月至次年3月刮东北季风，为雨季，降雨较多；4-9月刮西南季风，为旱季，降雨较少。

得天独厚的自然气候，使得马来西亚自然资源丰富。农产品主要有棕榈油、橡胶、可可、木材、胡椒和热带水果等，马来西亚是世界第二大棕榈油及相关制品的生产国和出口国、世界第三大天然橡胶出口国。马来西亚曾是世界产锡大国，因过度开采，产量逐年减少。马来西亚石油和天然气储量丰富，据《BP世界能源统计年鉴》显示，截至2019年底，已探明石油储量4亿吨（约28亿桶），在亚洲位列中国、印度、越南之后，排名第4位。2019年，马来西亚石油产量2980万吨，是东南亚仅次于印尼的第二大石油生产国。截至2019年，马来西亚已探明天然气储量9万亿立方米，在亚太地区排名第6位。

马来西亚是东南亚第一大天然气生产国，近10年天然气产量基本保持约700亿立方米的水平，可满足国内消费及出口需求。2019年天然气产量788亿立方米。此外，马来西亚铁、金、钨、煤、铝土、锰等矿产储量也很丰富。