绀碧之棺

绀碧之棺指的是神海岛的宝藏之地。在日本，绀碧原意为深蓝色，让人第一时间联想到大海。片中的“神海岛”则为日本冲绳群岛中的绀碧岛，神海岛上流传着两个传说，一个是沉入海底的古代遗迹"海底宫殿"，另一个是300年前真实存在的女海盗"安妮·邦尼"和"玛莉·雷德"遗留下来的财宝。“棺”是神海岛内如灵柩般的海底洞窟，这个洞窟是300年前的赖亲岛因地震沉入海底形成。洞内停泊一艘安妮期待着与玛丽再度扬帆出海的海盗船，这艘海盗船在300百年后的今天，踏上了第一次也是最后一次的航海之路。

战栗的乐谱

“战栗的乐谱”有两层含义，第一层含义，是指凶手为堂本音乐学院7名音乐家中的一个，这7名音乐家堂本一挥 、秋庭怜子、汉斯·穆勒、谱和匠、河边奏子 、千草拉拉 、山根紫音的名字连起来就是哆、来、咪、发、梭、拉、西；第二次含义，是指与炸弹联动的那个琴键，琴键与管风琴音管相联，音管里被安放了传感器，使得琴键传出的声音有了微妙的差别。琴键一旦敲下，管内的传感器就会感应气流传输信号，接收到信号的炸弹马上被引爆。

漆黑的追迹者

追迹者爱尔兰，是黑衣组织的谍报人员，他混入警察队伍的目的是找到存有组织内部人员资料的记忆卡，这一次黑衣组织变得被动，必须先警察一步找到记忆卡。爱尔兰在调查的过程中发现了柯南的真实身份，所幸的是，爱尔兰与琴酒一伙有间隙，最终爱尔兰为保护柯南而牺牲。临终前，爱尔兰鼓励柯南无论如何都要追下去。

天空的遇难船

天空的遇难船指的是巨型飞船贝尔·雪利二世号，全长246米，最大直径42.2米。这艘飞船是铃木园子叔叔次吉郎再次挑战怪盗基德而斥资制造的。恐怖组织红色暹罗猫登上了飞船，并劫持了全体船员。他们首领打算利用飞船制造生化恐慌，驱使人们去避难，好乘机盗走国宝大佛。巨型飞船不是为密室事件而准备的，而是为了让柯南有足够的空间大展身手，上演“虎胆龙威”营救。