哈哈，这个问题有意思了，宇智波灭门事件中谁才是最大的受益者？个人认为辉夜的意识黑绝才是最大的受益者，木叶村，团藏和晓组织都是黑绝复活辉夜过程中利用的对象而已，下面具体说明一下。

木叶村和宇智波一族的矛盾根源可以追溯到因陀罗和阿修罗的矛盾，因此从剧情角度来看二者之间的矛盾是不可能完全调和的，但是随着时间推移，为了维持忍者村内部和谐得到各大国更多的资源分配实际上后续剧情中木叶村和宇智波一族的矛盾并没有那么深，之所以后面非要弄到鱼死网破就和团藏为了谋取个人利益的所作所为有关系了。

因此个人认为表面上来说鼬执行完灭族行动以后让木叶村和宇智波一族的矛盾消失，但是实际上从宏观层面考虑还是让木叶村的整体战斗能力下滑。千手扉间之所以让宇智波一族承担木叶村警戒部队的任务，一方面是为了监视和控制宇智波一族的发展，另一方面就是看中写轮眼在战斗能力方面的加持。

因此即使在灭族行动过后木叶村收集了足够多的写轮眼，没有搭配其使用的宇智波一族族人特殊体质，木叶村并没有完全发挥写轮眼的作用。而在宇智波一族灭亡以后日向一族成为木叶村整体实力最强的宗族，但是实际上白眼的能力特点是擅长侦查，真正能够在战斗中压制对手还是写轮眼的优势更加明显。

而如果没有团藏要求鼬进行灭族行动的话，以宇智波一族的底蕴应该能够持续诞生具有不错忍者天赋的角色，这样一来即使木叶村由于九尾袭击事件造成大量人才损失，后辈力量依旧储备充足，甚至如果三代火影更加果断一些的话即使后面有大蛇丸袭击木叶村和佩恩入侵的事件，宇智波富岳，宇智波鼬和止水都能够有效分担三代火影的负担，甚至三代火影都有可能不需要牺牲。毕竟大蛇丸是比较受写轮眼幻术能力的克制的。

结果按照剧情发展宇智波一族灭族之后木叶村的中高层战斗力下滑幅度就越来越快了，新的木叶十二小强还没有成长起来，木叶村只能依靠三代火影和传说中的三忍撑老底。即使在后续剧情中木叶村能够起到决定战斗胜利的关键角色并不是木叶村中的大家族，而是漩涡鸣人，宇智波佐助以及几个为数不多的精英上忍。所以铲除宇智波一族的行动对于本来经历九尾袭击事件后实力受损的木叶村是进一步的打击，没有主角光环的话早就被其他忍者村解决掉了。