2003年，24集梅花档案第一次使用真的女尸体作为道具，而遭到广电总局审议。

内容讲述了解放初期，重庆公安局破获了一起潜伏的国民党特务组织，代号梅花，企图破坏雷达站的故事。

男主角肖克是刑侦队队长，龙云是特勤人员，公开身份是档案馆工作人员。俩人单身，肖克整剧下来，成天穿着公安制服，那时的公安制服跟部队一样，就是右膀上多个公安牌子，冷时再加穿一件短棉大衣。龙云常穿一件皮夹克，偶尔穿西装。导演这样处理让观众觉得剧情很真实。

前几集围绕着被镇压的特务头子白敬斋的老宅展开，骇人的配乐和阴森夜晚的老宅，令胆小的观众不敢看。

在这里龙云遇见了南云老师，曾是师妹，后来发展为恋人。谁知南云是白敬斋的大女儿，也是名潜伏的特务，因此在婚礼上出演了一场假自*，从此消失。

龙云为了找寻破案线索，在一个护士站遇见了白敬斋二女儿特务梅香护士，梅香护士对龙云一见钟情，龙云经过接触，判断梅香护士身份不简单，为了搞清状况，决定利用这层关系，打入特务组织。

凭着机智勇敢，很快摸清了特务组织架构，里应外合，部队一举攻克了深山里藏着的秘密基地。

最后利用其内部争权夺利，在南云帮助下，成功抓获了潜伏我党的高级特务。