地铁二号线西延工程由现状油坊桥站接出，经新河街至鱼嘴地区，线路延长5.6千米，新增4座车站和1座小型停车场，投资42.8亿元，规划建设期为2017至2020年。
| 地铁站名称 | 周围地标 | 换乘 |
| 鱼嘴站 | 规划建设中 | 9号线规划中 |
| 天保街站 | 规划建设中 | |
| 天保村站 | 规划建设中 | 7号线规划中 |
| 螺塘路站 | 规划建设中 | |
| 油坊桥站 | 天迈广场 | 8号线规划中 |
| 雨润大街站 | 南京明基医院 | |
| 元通站 | 南京国际博览中心、河西中央公园 | 10号线、河西有轨电车 |
| 奥体东站 | 南京奥体中心体育馆 | 河西有轨电车 |
| 兴隆大街站 | 凤凰文化广场 | |
| 集庆门大街站 | 河西万达广场 | |
| 云锦路站 | 侵华日军南京大屠*遇难同胞纪念馆 | |
| 莫愁湖站 | 莫愁湖公园、星湖饭店 | 7号线规划中 |
| 汉中门站 | 南京中医药大学 | |
| 上海路站 | 江苏省口腔医院 | 5号线规划中 |
| 新街口站 | 德基广场、新街口商业步行区 | 1号线 |
| 大行宫站 | 南京图书馆、总统府 | 3号线 |
| 西安门站 | 南京军区南京总医院 | |
| 明故宫站 | 明故宫、午朝门公园 | 8号线规划中、13号线规划中 |
| 苜蓿园站 | 明孝陵博物馆 | |
| 下马坊站 | 下马坊遗址公园 | |
| 孝陵卫站 | 南京理工大学 | |
| 钟灵街站 | 南京体育学院 | |
| 马群站 | 南京城东医院 | 12号线规划中、麒麟有轨电车建设中 |
| 金马路站 | 南京国际赛马场 | 4号线建设中 |
| 仙鹤门站 | 保利紫晶山 | |
| 学则路站 | 南京师范大学仙林校区 | |
| 仙林中心站 | 南京邮电大学仙林校区 | 8号线规划中 |
| 羊山公园站 | 南京外国语学校仙林分校 | |
| 南大仙林校区站 | 南京大学仙林校区 | |
| 经天路站 | 江苏体育训练中心 | 15号线规划中、S5规划中 |
各站点首末班车一览表
3号线
南京地铁3号线是南京地铁第二条开通的过江线路，地铁3号线途径浦口区、鼓楼区、玄武区、秦淮区、雨花台区和江宁区，线路北起林场站，南至秣周东路站，串联起江北新区、主城和东山副城。
线路全长44.87千米，其中地下线42.4千米，高架线2.4千米；共设置29座车站，其中地下站28座，高架站1座；列车为6节编组A型鼓型列车。
| 站数 | 站点名称 | 周围地标 | 换乘 |
|---|---|---|---|
| 1 | 林场站 | 老山林场 | |
| 2 | 星火路站 | 南京高新技术产业开发区西南侧 | |
| 3 | 东大成贤学院站 | 东南大学成贤学院 | |
| 4 | 泰冯路站 | 泰山新村和冯墙根 | S8号线 |
| 5 | 天润城站 | 天润城住宅小区 | |
| 6 | 柳洲东路站 | 柳洲路公交枢纽站 | |
| 7 | 上元门站 | 上元门 | |
| 8 | 五塘广场站 | 五塘广场 | 7号线规划中 |
| 9 | 小市站 | 欣芝园 | |
| 10 | 南京站 | 南京站北广场 | 1号线、9号线规划中 |
| 11 | 南京林业大学·新庄站 | 南京林业大学 | |
| 12 | 鸡鸣寺站 | 鸡鸣寺 | 4号线建设中 |
| 13 | 浮桥·华海3C广场站 | 珠江路 | 13号线规划中 |
| 14 | 大行宫站 | 南京图书馆、总统府 | 2号线 |
| 15 | 常府街站 | ||
| 16 | 夫子庙站 | 夫子庙 | 5号线规划中 |
| 17 | 武定门站 | 中城国际广场 | |
| 18 | 雨花门站 | 1865创意园 | 8号线规划中 |
| 19 | 卡子门站 | 宜家家居 | 10号线二期规划中 |
| 20 | 大明路站 | 窨子山古文化遗址 | |
| 21 | 明发广场站 | 南京明发商业广场 | 6号线规划中 |
| 22 | 南京南站 | 南京南站 | 1号线、S1号线、S3号线建设中 |
| 23 | 宏运大道站 | 南京左邻右里 | |
| 24 | 胜太西路站 | 胜太广场 | 12号线规划中 |
| 25 | 天元西路站 | 文化名园 | |
| 26 | 九龙湖站 | 颐和南园 | |
| 27 | 诚信大道站 | 清水亭学校 | 5号线规划中 |
| 28 | 东大九龙湖校区站 | 东南大学九龙湖校区 | |
| 29 | 秣周东路站 | 砂之船奥特莱斯艺术商业广场 |
各站点首末班车一览表
4号线
南京地铁4号线2017年1月通车运营，标志色为紫色。地铁4号线一期途径鼓楼区、玄武区、江宁区和栖霞区，线路西起龙江站，由南京主城一路向东，北绕紫金山，进入麒麟新城，东至仙林湖站。西端预留过江条件通往新南京北站，即二期工程。
