活性碳（第二层，化学过滤）

活性碳是种多孔性含碳物质，木炭及竹炭也都属于活性碳。活性碳同时具有「物理过滤」及「化学过滤」的功能，可以有效去除水中的微量成分、色素、臭味等，需注意若鱼缸处于下药期间需先将活性碳移除，避免药效都被活性碳吸附而无法产生治疗效果，结束用药期间后可以将活性碳放回水中吸附水中残余的药剂，使水质净化。

泥炭土（第二层，化学过滤）

生物砂（第二层，化学过滤）

有时候在鱼缸过滤那边会有异味，这表示可能水质平衡没有做好，生物砂主要是透过氢离子提升环境负电位来吸异味，还可以消除水中阿婆尼亚、降低亚硝酸，是近期笔者看到比较有兴趣的产品，而活性碳也算是有同样功效，但不一样的是生物砂不会发霉、不会有吸附饱和还有不用项活性碳一样需要有还原这个过程！

生化棉（第三层，生物过滤）

一般生化棉设置于第二层，在粗棉or白棉之下，生化棉的特性是不易烂且孔隙较大，适合作为硝化菌的培菌滤材，当孔隙被脏污堵满需要清洗的时候，可以将部分生化棉取出使用原缸水进行简单的清洁。避免将全部生化棉取出及使用自来水直接清洗，如此将造成过滤系统中的硝化菌消失殆尽，容易造成系统崩解丧失分解有毒物质的能力。

网路上也流传生化棉可以使用菜瓜布替代，这点笔者也有使用过，将菜瓜布置放于自制的水妖精中，目前看来效果并不比生化棉差。菜瓜布能有此效用主要是有几点跟生化棉是相似的，久洗不易烂、多孔隙等特点。菜瓜布使用前建议先用清水多冲洗几次并用热水煮过，主要是怕菜瓜布是否有残留的化学药剂，虽然前置作业稍微麻烦点，但只需要做一次就可以用很久了，C /P值算是相当高的替代方案。