2008年8月1日，北京南站正式重新启用。至此，华丽转身后的北京南站以全新的面貌展现在世人面前。

从空中俯看这个约20个足球场大小、相当于1.5个 “鸟巢”面积的银灰色现代化客站，整个建筑呈椭圆形，主体为钢结构，分为主站房、雨篷两部分。主站房采用双曲穹顶设计，最高点40米，以天坛鸟瞰效果为基本形状，中间设有3个层次，隐喻中国皇家建筑的层次感和风格。建筑地上2层，地下3层，从上到下依次为高架候车层以及配合的高架环形车道、站台轨道层、换乘大厅、地铁线。

北京南站站台轨道层共设13个站台，24条到发线，3个客运车场。其中从北往南依次为：普速场设到发线5条、3座站台；高速场设到发线12条、6座站台；城际场设到发线7条、4座站台。

高架候车层在地上二层，中央为独立的候车室，可容纳1.05万人同时候车。东西两侧是进站大厅，自北向南依次为各候车区。高架候车层的四个角设有售票办公楼，车站共设置了84台窗口售票机和39台自动售票机。检票进站全部由自动验票系统控制。