黄柏是治疗黄疸的常用药，取其能够清热燥湿，当湿热之邪郁蒸于内，外映体表出现目黄、身黄之黄疸，取黄柏、栀子组成栀子柏皮汤清热利湿退黄。

湿热下注，不止步于肾、膀胱、大肠，而继续向下，就会出现脚气恶臭、下肢肿痛等，黄柏配伍苍术、牛膝，组成三妙丸清下肢湿热邪气、通络止痛。

黄柏主入肾经，苦寒之性，善泻相火，对于一些阴虚所致的骨蒸烦热、阴虚火旺、潮热盗汗、腰膝酸软、遗精等症状，黄柏也有一定的疗效，常常取黄柏配伍补益阴精的药材例如生地黄、山药等组成知柏地黄丸，补益肾精、清热除烦。

黄连、黄芩、黄柏，三药的性能皆苦寒相近，其中黄连最为苦寒。三种药均是清热燥湿的代表药，对于湿热内盛或热毒炽盛的疾病，三药常相须使用，提高清热燥湿、泻火解毒的效果。但是黄芩偏向于清泻上焦肺火，更多用于肺热咳嗽。黄连倾向于清泻中焦胃火，更多用于治疗胃火炽盛、中焦湿热所致的痞满呕逆、高热心烦等。黄柏更擅长清泻下焦相火、除骨蒸烦热，常用于治疗骨蒸劳热、湿热下注下焦等疾病。