但是，时光穿越出现了差错，詹姆斯被送到了1990年的巴尔的摩。在不知道真相的情况下，詹姆斯急于想要完成任务，他逢人就打听病毒的消息，他的异样引起了精神病医生凯瑟琳·瑞莉的注意，并将他诊断为精神分裂和幻想症。

被关进疯人院后，他认识了格外健谈的病友杰弗里·戈因斯，当杰弗里得知詹姆斯要逃走，便很仗义地帮助了他。

虽然这次出逃没有成功，但关在黑屋里的詹姆斯却被2035年的科学家救回。由于这次获取的信息有限，詹姆斯随即开始了第二次穿越，这一次他被送到1917年一战时期的战场，并且受了枪伤，就在他疼痛之时他又迅速穿越到1996年的巴尔的摩。

巧合的是，他捡到凯瑟琳医生演讲的宣传单页，于是他决定让凯瑟琳帮助他前往病毒的发源地费城。

经过一路的猜忌、辩解、争执，两人终于来到费城并且获取了十二猴军团的相关信息:杰弗里正是十二猴军团的首领，他的父亲是著名的病毒专家，他反对父亲虐待动物的行为，他决定要用毁灭性的方式对抗和惩罚他的父亲。

获取信息后，詹姆斯在逃跑过程中穿回到2035年，这一次科学家们很满意詹姆斯的调查结果，并决定特救他，但是詹姆斯以拯救人类为名却要求再次穿越，与此同时，凯瑟琳在自己研究资料里的一张照片中发现了詹姆斯的身影,于是她越发相信詹姆斯的病毒毁灭说。

幸运的是，以杰弗里为首的十二猴军团只是一个动物解放运动协会，他们只想要还给动物自由，并没有散播病毒。

但不幸的是，就在詹姆斯和凯瑟琳放松警惕的时候，真正的病毒携带者一杰弗里父亲的助手皮特斯出现在机场，詹姆斯没能击毙皮特斯，却被警察击倒在地，死在凯瑟琳怀中。