一幕幕似曾相识的场景让詹姆斯疲惫不堪，这种交错感、混乱感让他开始怀疑自己的精神问题，直到最后一次穿越，面对焦急的凯瑟琳，詹姆斯突然承认自己患有严重的精神分裂，他希望通过她的治疗回归一个正常人的生活。

无论是1996年还是2035年，詹姆斯总是在以逃跑的姿态被动的完成任务。他没有被视为拯救人类的英雄，他也不能自主选择普通人的平静生活。

他在一次次时间旅行中饱受潜意识的压抑，他永远无法摆脱潜意识对自己的控制，他在茫然中沦为潜意识的奴隶。

影片中，当杰弗里被朋友质问凯瑟琳为什么会知道他们的计划时，杰弗里以疯癫的状态给出严肃的答案。他解释道，1990年医生们为了研究他的大脑，进行X光照射后，将他的资料输入电脑，并以此制作出其思想模型，得知他在10年后的每一件事。

这个来自于精神病人的臆想却暗含着影片对于意识研究的大胆设想以及科学探索的执着精神。

20世纪初期，世界大战、经济危机、信仰危机以及社会动荡等，沉重打击了西方人以理性崇拜为核心的自恋心理传统，他们开始否定人生理想，流露出对茫茫未来的彷徨与苦闷。

在这种文化背景和文化心理的孕育下，西方的艺术作品逐渐表现出一种对于非理性现实的把握，表现出鲜明的荒诞感。影片《十二猴子》无论从情节抑或主题都呈现富有意蕴的荒诞性。

不同于常规科幻片的模式，影片《十二猴子》最终的胜利力量是整个动物世界，这个同样庞大的群体没有依靠灵长类动物的武装，也没有依靠食肉动物的凶猛攻击，仅仅凭借一个人类个体的极端想法，就轻易占据了整个地面的绝对统治权。