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方差分析结果描述(方差分析法确定主要因素)

来源:原点资讯(m.360kss.com)时间:2024-05-19 15:37:02作者:YD166手机阅读>>

我们可以清楚地看到数据不遵循高斯分布。

有不同的数据转换方法可以使数据接近高斯分布。我们进行Box-Cox变换:

dataNew['Dense1'],fitted_lambda = stats.boxcox(dataNew['Dense1']) dataNew['Dense2'],fitted_lambda = stats.boxcox(dataNew['Dense2']) dataNew['Dense3'],fitted_lambda = stats.boxcox(dataNew['Dense3']) dataNew['Dense4'],fitted_lambda = stats.boxcox(dataNew['Dense4'])

现在让我们再次绘制它们的分布图来检查:

方差分析结果描述,方差分析法确定主要因素(9)

方法1:使用statsmodels模块进行单向方差分析

Python中有两种方法可以执行ANOVA测试。一个是stats.f_oneway()方法:

F, p = stats.f_oneway(dataNew['Dense1'],dataNew['Dense2'],dataNew['Dense3'],dataNew['Dense4']) ## 看看整体模型是否重要 print('F-Statistic=%.3f, p=%.3f' % (F, p))

我们发现p值<0.05。因此,我们可以拒绝零假设——不同密度组之间没有差异。

方法2:用OLS模型进行单因素方差分析

正如我们在回归中所知道的,我们可以对每个输入变量进行回归,并检查其对目标变量的影响。所以,我们将遵循同样的方法,我们在线性回归中遵循的方法。

model = ols('count ~ C(density_Group)', newDf).fit() model.summary()

方差分析结果描述,方差分析法确定主要因素(10)

## 看看整体模型是否重要 print(f"Overall model F({model.df_model: .0f},{model.df_resid: .0f}) = {model.fvalue: .3f}, p = {model.f_pvalue: .4f}") #创建方差分析表 res = sm.stats.anova_lm(model, typ= 2) res

从以上输出结果可以看出,p值小于0.05。因此,我们可以拒绝不同密度组之间没有差异的零假设。

F-statistic= 5.817,p-value= 0.002,这表明density_Group对日冕阳性病例有总体显着影响。但是,我们尚不知道desnity_groups之间的区别在哪里。因此,基于p值,我们可以拒绝H0;就面积密度和日冕例数而言,没有显着差异。

事后比较检验

当我们进行方差分析时,我们试图确定各组之间是否存在统计学上的显着差异。那么,如果我们发现统计学意义呢?

如果发现存在差异,则需要检查组差异的位置。因此,我们将使用Tukey HSD测试来确定差异所在:

mc = statsmodels.stats.multicomp.MultiComparison(newDf['Count'],newDf['density_Group']) mc_results = mc.tukeyhsd() print(mc_results)

方差分析结果描述,方差分析法确定主要因素(11)

Tuckey HSD测试清楚地表明,Group1 – Group3,Group1 – Group4,Group2 – Group3和Group3 – Group4之间存在显着差异。

这表明,除上述两组外,所有其他日冕病例数的成对比较均拒绝零假设,且无统计学显著性差异。

假设检验/模型诊断正态分布假设检验

当使用线性回归和方差分析模型时,假设与残差有关,而不是变量本身。

方法1:Shapiro-Wilk试验:

### 正态性假设检查 w, pvalue = stats.shapiro(model.resid) print(w, pvalue)

从上面的代码片段中,我们看到所有密度组的p值都大于0.05。因此,我们可以得出结论,它们遵循高斯分布。

方法2:Q-Q图试验:

我们可以使用Q-Q图来检验这个假设:

res = model.resid fig = sm.qqplot(res, line='s') plt.show()

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