片场气氛凝重，鲜少笑声，为排遣好友心中郁积，罗宾·威廉姆斯会不时打电话给斯皮尔伯格，讲搞笑段子逗他开心，而斯皮尔伯格每天收工后必做的则是观看当时的电视喜剧《宋飞正传》录像。
抑郁和沮丧笼罩着他，开拍很久后他依然不敢期冀观众会接受这部由斯皮尔伯格导演的《辛德勒的名单》。
拍摄中， 斯皮尔伯格放弃使用故事板，转而采用纪录片的摄制方式，并从大屠*纪录片《扭曲的十字》（1956）和《浩劫》（1985）中汲取灵感。
影片40%的镜头由手持摄影机拍摄，不使用吊臂、稳定器、变焦镜头和任何能营造出安全感的设备，这种风格让斯皮尔伯格觉得自己像个艺术家——
使用有限的拍摄器材、完全不希冀影片的商业成功。
此时的他已不再是“电影彼得·潘”了。那个曾对西席·地密尔和大卫·里恩顶礼膜拜的电影小子，在《辛德勒的名单》中形成了完全属于自己的拍摄风格。
基于有限的资金预算（2200万美元），拍摄计划被迫压缩到75天，斯皮尔伯格还要同时兼顾《侏罗纪公园》的后期制作。日程紧迫，有几天甚至一口气拍了55场戏。
“拍摄节奏像闪电一样，冷峻、客观、不动声色。”泽里安（编剧）说，“有一场戏，需要镜头先翻转再捕捉拍摄目标，但拍了三遍，动态捕捉都不够理想，斯皮尔伯格就这么让过了，还说，不完美就不完美吧。”
在斯皮尔伯格看来，这样的拍摄为影片营造出一种“即兴感和边缘感”，恰好完美地支撑了故事主题。
连姆·尼森则感叹斯皮尔伯格的导演风格与伍迪·艾伦颇为相似：“下场戏他打算怎么拍？没人知道。你得以‘无状态’的方式进入状态。”
许多重头戏到最后一秒才构思成形，例如辛德勒劝说戈斯批准他转移犹太工人的戏，开拍前一秒斯皮尔伯格突然冲尼森喊道：“我知道怎么拍了！你先站外面，我在里面镜头对着你拍，然后我稳住镜头，你走进来再走出去。这场戏太重要所以就放手一搏吧！”
“他要的就是这种不完美，”泽里安说，“这是一种即兴抓取的手法，难度丝毫不亚于周密计划的拍摄。”
六
片中饰演纳粹军官的都是德国演员。有别于《夺宝奇兵》里的“好莱坞纳粹”，斯皮尔伯格说这些党卫军角色才是“真纳粹”——
“他们都是优秀的德国演员。聊天时他们会告诉我身穿纳粹军服让他们有多恶心难受，他们也不讳言父辈参战的事。
很多人对我表达谢意，说通过参演本片解开了很多儿时的疑惑。逾越节那天，这些德国演员全部戴上犹太小圆帽、手捧犹太法典《哈加达》坐在以色列演员中间参加祈祷仪式。目睹这些我哭得像个孩子。”
