从上校口中我们得知，原来导弹并不是叛军发射的。甚至在后续找到的资料中显示，治安者的领袖杰克，并不是一个好人。叛军势力为啥叫叛军，实际上就是杰克给人家整的名字。之前城中散落大量黄色的化学药剂，一进去免疫力大幅度降低，稍有不慎直接死亡。当时军队为了遏制变异的局势，散布了大量此类化学药剂。然而这并不是上校*，只是军队更高的将领下达的命令，不过在杰克的煽动下锅就给上校背了。还给他取了个“刽子手”的光荣头衔。
然而不少观众第一次进叛军要塞，都感觉画风不怎么对。按理说看他们之前的行为怎么看都不像是好人，各种坏事做尽的黑恶势力模样。为啥一进要塞里面的人们安居乐业，小孩开心得玩耍，这分明比生存者的营地还和谐啊？
原本杰克和上校威廉姆斯都属于军队，在局势恶化后，一次任务中上校派遣杰克带领小队执行一个较为严苛的任务。然而杰克不服从命令，煽动部分人哗变，基于这部分人最后形成了治安者。虽然后期成型的治安者还算做好事，特别是罗维小队的铁血硬汉，但本质上杰克还是对他的老领导心怀不满。最后水火不相容。
但此刻也有观众说不对啊，之前部分叛军确实很坏啊。各种袭击营地什么的。我后来回看录像，才发现了个问题。很多看起来很坏的叛军，其实并不是上校的叛军，而是华尔兹带走的部分叛军。而且弗兰克被叛军*死的分支，竟然是杰克派手下假扮叛军的人*。这也导致上校都很疑惑？啊？我就只派了一个人开车来接你，怎么就是我的人*？
此刻我们也明白了，为什么无线电中杰克一直怂恿叫嚣我们进攻要塞，还要放下水闸让治安者部队发起进攻。他就是为了报仇和清除其他势力，自己能成为维勒多之王。
在这里可选择相信上校还是选择相信杰克。选择杰克会和上校爆发冲突，之后开闸放水，为治安者的进攻开道。最后他告诉你真相后掏出了一把失传很久的手枪，饮弹自尽。唯一有点气的就是你死了就死了，手枪咋还捡不了。这可是目前我看到过唯一一把真正意义上的枪。游戏下方的地图将会解锁，在这里会多出现新种类的自爆丧尸。
如果我们选择相信上校，那么杰克就会恼羞成怒。新区域也只能通过游泳和潜水进入。无论怎么选，上校最后都会告诉我们，导弹的来源和X13有关系。要想阻止城市的毁灭，那么就要赶紧到X13阻止华尔兹。
最终我们来到X13，这里是GRE在这个城市最核心和机密的地方。我们赫然发现里面存放大量的赖以生存的物资和尖端设备。
这里我们如果之前选择无线电时没有给弗兰克，哈肯会在这里出现和华尔兹狼狈为奸。但看到敌人向拉万射过去，他还是不忍心拉万受伤，和敌人发生冲突最后会在这里死去。
如果我们之前选择无线电时给了弗兰克，我们在之前就会遇上哈肯与他在教堂决战，当时也会有选择是否饶恕哈肯。之后也会有弗兰克召集夜行者归来，哈肯重回队伍，拉万成功加入夜行者的剧情。
最终我们来到了整个游戏中，我们多次回顾和梦魇的场景。也是主角小时候和妹妹米娅接受实验之地，甚至我们还看到了当时两人一起的病床。
游戏一直以来给了我们一种，小孩们被人抓起来，然后被迫接受生化实验的错觉。随着我们调查周围的文件和信息发现，孩子们对这里并不恐惧。甚至对华尔兹也表现出喜欢的感觉。这就奇了怪了。
我们在此找到了华尔兹，他在病床前守护着一名白衣女孩。此刻的他没有之前展现的攻击性，也愿意和我们好好交流。一番对峙，华尔兹告诉我们这一切的真相。
原来所谓的妹妹米娅，并不是我们真的有血缘关系的妹妹，而是华尔兹的女儿。病毒爆发时，残存的医疗人员发现病毒能直接感染成年人，但小孩子却有天然的抵抗力。为此华尔兹收养了许多孤儿做实验，试图研发解药，同时也是为了救自己的女儿米娅。
游戏前期剧情一直让我们误解，以为华尔兹在利用孩子干一些伤天害理之事。我们的主角就是当时那批孩子的其中之一，并且在实验中表现极其出色。如果一切顺利，那么可能解药就此被研制出来，世界也不会就此毁灭。然而实验室的一场火灾导致艾登和米娅失散，也让解药的唯一希望就此消失。
因为那时候青梅竹马，两个孩子互相依存，再加上药物的作用。让主角产生了一种错觉和选择性失忆，以为米娅是自己的亲妹妹。当华尔兹得知治安者指挥官获得GRE钥匙后，于是以威胁哈肯的恋人，会*害拉万为条件，逼迫之前我们的线人迪伦和哈肯去*掉指挥官夺取GRE钥匙。线人迪伦在拿到钥匙后，他作为一名前GRE的人，他知道如果钥匙给华尔兹激活了X13后意味着什么。于是他决定背叛华尔兹，在开篇把钥匙交给了我们。
华尔兹之后夺得钥匙重启电源，都是为了来到X13。因为这里还有仅存的医疗设备，能有条件救自己女儿一命。而导弹的发射，曾经是GRE在X13所设置的一个“保护协议”。该协议内容便是在疫情失控时，会从X13基地发射导弹摧毁整个城市。本来城市在多年前电力被上校关闭，让协议暂时失效。维勒多的人民才存活下来。
华尔兹不顾一切争夺GRE钥匙，也是为了接上电源，再次启动X13来救自己的女儿。然而X13背后的“保护协议”也会再次启动。导弹准备发射，维勒多将面临灭顶之灾。
此刻我们和华尔兹面临一种两难的困境，钥匙开启后的医疗设备维持着米娅的性命，但导弹会让更多人惨死。想要阻止导弹的发射，也必须用钥匙关闭设施，米娅就此失去医疗保障而丧命。
一个是对更多的人的大爱，一个是父亲对女儿的爱。某种意义上来说两人处于自己的立场都不算错。最终BOSS战不可避免的展开，不过说实话这作的BOSS并没有多大的难度。还没有一代圣母之战难度高。
在三轮交手后，双方都爆发了病毒的力量殊死一搏。最终米娅的出现阻止了他们俩，然而GRE钥匙在争抢中就此损毁。导弹即将发射，无线电中传来了拉万的呼喊。拉万为了拯救城市，决定带着手动引爆的炸弹直接将导弹摧毁在X13。
此时进入了最终的分支选择阶段，根据之前无线电归属和其他分支的选择，会影响结局剧情。
